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Sensitivität und Spezifität

maiLab: Corona im Herbst | Ändern Schnelltests alles? “Wie können wir die befürchtete zweite Corona-Welle verhindern? Das Testen spielt dabei eine große Rolle. Aber dazu müssen wir verstehen, welche Tests es gibt und wie man Kennwerte wie Sensitivität und Spezifität bewerten muss. Gleichzeitig machen Tests Hoffnung, die zwar eine geringe Sensitivität haben, aber schneller und billiger eingesetzt werden könnten.”

Besonders interessant finde ich die beiden Abschnitte zur Sensitivität und Spezifität von Tests und dem PPW, die man sicher gut im Schulunterricht einsetzen kann: Yay Statistik! Sensitivität & Spezifität, Sehr wichtig: Der positiv prädiktive Wert.

“In der vergangenen Woche lag dieser stabile R-Wert an keinem Tag über eins”

Deutsche Welle: Corona-Krise: RKI führt neue R-Kennzahl ein. “Mehrere Tage lag hierzulande die Corona-Reproduktionszahl R wieder über eins. Und sie wirft wegen statistischer Unsicherheiten allerlei Fragen auf. Deshalb kündigte das Robert Koch-Institut nun eine neue Kennzahl an.”

“Wie in anderen Ländern rechnen Experten auch in Deutschland mit einer hohen Dunkelziffer nicht erfasster Infektionen. [RKI-Vizepräsident Lars] Schaade betonte daher, das Einhalten der Abstands- und Hygieneregeln sei weiterhin sehr wichtig. “Helfen Sie mit, das Virus auch weiterhin in Schach zu halten. Es ist noch da, auch wenn es deutlich weniger geworden ist”, mahnte er.”

Crashkurs zu den Daten über Corona

Quarks.de (WDR): Was die Daten zu Corona aussagen und was nicht. “Mit dem neuen Coronavirus preschen täglich neue Zahlen auf uns ein – mehr Infizierte, neue Todesfälle, dazu Berechnungen über Verdopplungsraten und Sterberate. Wir erklären, was das bedeutet, was oft falsch gemacht wird und wo die Wissenschaftler noch streiten.”

Erklärt werden Basisreproduktionszahl, effektive Reproduktionszahl, Morbidität, Prävalenz, Verdopplungszeit, Mortalität (Todesrate, Sterblichkeit), Letalität, Fall-Verstorbenen-Anteil (CFR, englisch: case fatality rate), infection fatality rate (IFR), Manifestationsindex.

Different ways to model a pandemic

Numberphile: The Coronavirus Curve. (YouTube, 22:17min) “Ben Sparks explains (and codes) the so-called SIR Model being used to predict the spread of coronavirus (COVID-19).”

I played along at home and created my own version with Geogebra, but you can also find Ben Sparks’s version here: SIR Model.

Be sure to also check out the links in the description of the video.

3Blue1Brown: Simulating an epidemic. (YouTube, 23:11min)

“While here we looked at what you might call an “agent-based” SIR model, if you want to see what it looks like as a set of differential equations, Ben Sparks just did a lovely video on the topic over at Numberphile [see above].

There are a few reasons I like the agent-based model here, for demo purposes at least. It’s a bit easier to understand for those who are not comfortable yet with ODEs, for one. It also conveys how things are not deterministic; no real-world curve will look as smooth as the differential equations. It also makes it way easier to ask questions and bake other assumptions into the model. Introducing things like travel or community centers into the differential equations would get very hairy very quickly. For those who want to go much more deeply into this, the Institute for Disease Modeling has a lot of models free for people to look at and play with.”